據中國農科院最新消息，該院棉花研究所聯合國內多家科研機構開展的亞洲棉和陸地棉2項研究，揭示了亞洲棉在中國的演化歷史，構建了完整的棉花A基因組變異圖譜；對陸地棉遺傳多樣性和群體結構進行了系統分析，鑒定到大量與其纖維長度、強度密切關聯的主效QTL位點。2項成果同時在線發表于《自然遺傳學（Nature Genetics）》。

由棉花所李付廣團隊等承擔的“亞洲棉多樣性及演化的遺傳學基礎研究”，通過對243份二倍體棉花種質材料重測序，比較不同生態型群體之間的分化程度，共鑒定出163個遺傳分化區間，揭示了人工選擇及生態地理對基因組的影響；通過聚類及馴化相關性狀分析，揭示了中國的亞洲棉可能最早來源于華南，從南往北逐漸擴散到長江和黃河流域。發現了決定亞洲棉抗病性的關鍵變異位點，為將二倍體棉花優良抗逆性狀導入廣泛種植的四倍體棉花奠定了重要遺傳基礎。

由棉花所杜雄明團隊等承擔的“陸地棉核心種質基因組變異及其影響纖維品質和產量的關鍵位點研究”，首次利用我國419份陸地棉核心種質發掘了約366萬個SNP標記，完整搜集了13個纖維性狀在12個環境中的表現，利用關聯分析發掘了一大批重要性狀相關的位點和基因，并對關鍵候選基因進行了功能驗證，系統地開展了纖維產量、品質、生育期等性狀的全基因組關聯分析（GWAS），為棉花重要性狀定向育種提供了較為精準的標記和基因資源，在該項研究中一躍居于國際領先行列。