中國學者成功破解中國種茶樹全基因組密碼
- 來源:中國熱帶農業科學院 2018-06-06 05:11:41
當前,世界主栽茶樹分屬兩個變種: 中國種和阿薩姆種。省部共建茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室安徽農業大學宛曉春教授研究團隊,聯合深圳華大基因和中國科學院國家基因研究中心等相關研究團隊,以國家級茶樹品種舒茶早(中國種)為材料,用二代和三代測序技術對其進行測序,采取雜合組裝策略,獲得覆蓋基因組93%區域的高質量序列草圖,注釋出33,932個高可信度的茶樹基因。研究結果顯示,中國種基因組大小為3.1Gb,重復序列含量為64%,基因組組裝的完整性和質量遠高于現有同類已測序物種組裝水平。研究發現,茶樹祖先種大約在8000萬年前與親緣關系最近的獼猴桃物種發生分化,繼而在38-154萬年前,又分化形成中國種和阿薩姆種。
宛曉春教授研究團隊發現了一個參與茶氨酸合成的關鍵酶基因(CsTSI),并通過轉錄組學和轉基因分析,證明CsTSI具有合成茶氨酸的酶活性。比較基因組分析發現,萜烯類等物質的合成酶基因拷貝數在茶樹基因組中也發生顯著擴增,有助于解釋茶葉獨特的香氣。這些發現首次從基因組層面系統解開了茶葉中富含獨特的風味物質之謎。
以上研究成果,將極大促進對山茶屬植物的物種進化、茶葉風味物質形成機理與品質調控、分子育種、茶樹種質資源保護與利用和茶的健康功能成分研究,對中華茶文化的繁榮與傳播等也具有重要意義。相關成果近期發表于《美國科學院院刊》上。
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